Sérgio,
É na FB50 sim, porém o lançamento contábil não recebe moedas nível ítems de documento, mas sim por cabeçalho.
Isso que dizer que você não pode ter um documento com 1 ítem de documento e outro item de contrapartida com outra moeda.
C - Conta PEN - PEN 300,00
D - Conta USD 100,00
Se sua empresa tiver moeda interna em USD ou PEN você terá que lançar um documento em PEN com ítens:
Documento em PEN (Ou USD com ítens da mesma forma)
C - Conta PEN - PEN 300,00
D - Conta USD - PEN 300,00
Uma conta definida para uma moeda estrangeira (diferente da Empresa) só pode ser lançada em um documento de mesma moeda em seu cabeçalho.
Outro cenário possível é se sua empresa for em BRL, você deverá lançar 2 documentos junto com 1 conta transitória:
Documento em PEN
C - Conta PEN - PEN 300,00
D - Conta transitória - PEN 300,00
Outro documento em USD
C - Conta transitória - USD 100,00
D - Conta USD - USD 100,00
Por que 2 documentos? Nem a conta em USD nem a conta em PEN podem ser lançadas em BRL, logo serão 2 documentos.
Verifique se o seu caso estão de acordo com um dos dois cenários acima.
Att.